Reaksi-Reaksi Spesifik Nukleotida

REAKSI-REAKSI SPESIFIK NUKLEOTIDA

Okay, pada kali ini saya akan memaparkan materi tentang reaksi-reaksi spesifik pada nukleotida. Baik tapi sebelum kita membahas lebih detil tentang materi ini maka ada baiknya jika kita mengetahui apa itu nukleotida. Nah, nukleotida adalah satu nukleosida yang berikatan dengan gugus fosfat. Di dalam molekul DNA atau RNA, nukleotida berikatan dengan nukleotida yang lain melalui ikatan fosfodiester. Nukleotida yang mengandung deoksiribosa disebut deoksiribonukleotida, sedangkan yang mengandung ribosa disebut sebagai ribonukleotida (Ngili, 2013: 293).

Molekul nukleotida terdiri atas nukleosida yang mengikat asam fosfat. Molekul nukleosida terdiri atas pentosa (deoksiribosa atau ribosa) yang mengikat suatu basa (deriva purin atau pirimidin). Jadi apabila suatu nukleoprotein dihidrolisis sempurna akan dihasilkan protein, asam fosfat, pentosa dan basa purin atau pirimidin (Poedjiadi, 1994: 130).

Dalam alam nukleosida terutama terdapat dalam bentuk ester fosfat yang disebut nukleotida. Nukleotida terdapat sebagai molekul bebas atau berikatan dengan sesama nukleotida membentuk asam nukleat. Dalam molekul nukleotida gugus fosfat terikat oleh pentosa pada atom C-5(Poedjiadi, 1994: 131).

Beberapa nukleotida lain ialah sebagai berikut:

Adenin nukleotida (Asam Adenilat)	Atau	Adenosinmonofosfat (AMP)
Guanin nukleotida (Asam guanilat)	Atau	Guanosinmonofosfat (GMP)
Hipoksantin nukleotida (Asam inosinat)	Atau	Inosinmonofosfat (IMP)
Urasil nukleotida (Asam uridilat)	Atau	Uridinmonofosfat (UMP)
Sitidin nukleotida (Asam sitidilat)	Atau	Sitidinmonofosfat (SMP)
Timin nukleotida (Asam timidilat)	Atau	Timidinmonofosfat (TMP)

Ketika nukleotida dipolimerisasikan, atau bergabung bersama-sama, mereka membentuk asam nukleat, seperti DNA atau RNA. Setiap fosfat nukleotida yang telah bergabung dengan gula lain, membentuk tulang punggung gula-fosfat dengan basa nitrogen menggantung di samping.
Sebuah nukleosida (perhatikan ‘s’) adalah bagian dari nukleotida yang hanya terbuat dari gula dan basa. Jadi kita bisa berbicara tentang nukleotida sebagai nukleosida ditambah fosfat:
Sebuah monofosfat nukleosida adalah nukleotida yang mencakup satu fosfat.

Sebuah difosfat nukleosida adalah nukleotida yang mencakup dua fosfat.

Sebuah trifosfat nukleosida adalah nukleotida yang mencakup tiga fosfat.

Nukleotida dapat siklik (seperti siklik AMP), yang berarti bahwa alih-alih satu ikatan antara fosfat dan gula, fosfat terikat pada gula di dua tempat. Pikirkan memegang kedua tangan seorang teman, dari atas, lengan dan lengan teman Anda terlihat seperti lingkaran. 

METABOLISME NUKLEOTIDA

Perannya diantaranya membentuk DNA dan RNA. Membentuk UDP glukosa membentuk ATP dan GTP membentuk NAD, FAD dan membentuk cAMP. Nukleosida diantaranya adalah purin atau pirimidin yang terikat dengan pentosa. Sedangkan nukleotida adalah ester fosfat dari nukleosida. Basa purin pertama yaitu adenin dan guanin. Cincin purin diantaranya adalah glycin glutamin aspartat. Cincin pirimidin diantarany adalah aspartat dan carbomoilfosfat. 

dalam biosintesis nukleotida ada dua jalur, yaitu :

1) Jalur de novo

Nukleus fosfat yang menyusun purin dan pirimidin berasal dari PRPP. Nah PRPP ini sendiri dari Ribosa 5 fosfat + ATP. Ribosa 5 fosfat berasal dari HMP shunt. PRPP ini sendiri akan diubah menjadi fosfo ribosil 1 amin. Dengan enzim amidofosforibosil transferase dengan bantuan glutamin sebagai pendonor NH3. Lalu melewati 10 rangakaian reaksi akan membentuk IMP. IMP ini sendiri akan membentuk adenilosuksinat dan xantilat. Nah adenilosuksinat akan membentuk AMP sedangkan xantilat akan membentuk GMP. 

2) Jalur salvage pathway (recycling)
Disini PRPP akan diubah menjadi purin-ribonukleotida.
Contohnya Adenin + PRPP jadi adenilat + Ppi. 

PERMASALAHAN:

   1)      Apa perbedaan antara Nukleotida dan Nukleosida 

   2)      Bagaimana jika susunan dari basa nitrogen (Agenin, Guanin, Cytosin, dan Timin) pada DNA letaknya tidak sesuai dengan yang sebenarnya? Maka apa yang akan terjadi?

   3)      Faktor apa saja yang menyebabkan terjadinya perubahan susunan basa nitrogen?